五月十二，秀保准备返回日本，万历帝挽留，秀保婉拒，帝遂遣百官送至城外，实乃尊贵至极；
五月十三，阔别二十年后，万历帝决定上朝，一改荒怠，励精图治，朝堂上下无不惊喜万分；
六月中，万历帝决心整顿吏治，治理朝堂党争，同时安抚流民，休养生息，重开海禁，鼓励海外贸易，加强对西方知识的学习和自主创新；这一系列大刀阔斧的改革一直持续到五年后万历帝病逝，史称“万历新政”；
八月初，万历帝敕封秀保为日本国王，同时按照国内亲藩为之定号“和王”，位同朱氏亲藩，朝臣多有上疏反对者，然帝异常坚决，百官只得奉诏；
十月中，万历帝于京师为秀保修建和王府，另配备杂役府兵千余人，邀秀保每三年来京居住三月，秀保遣嫡子河内满国赴京谢恩，帝赏金百两，绸缎百匹；
十二月初，应秀保之请，万历帝派遣儒学大家及门生百余人渡海赴日本讲学，秀保于每律令国兴建儒学馆一所，要求各家大名子弟入馆修学，每三年遣派品学兼优者五十人赴大明国子监深造，并且指明优先选派嫡子前往；此举被后世认为是强化明日交流和文化同化的开始；
四年（1620）
三月二十三日，水户藩主石田三成不顾身患重病，执意前往伏见觐见秀保，在得到秀保“扶持秀赖成为关白”的承诺后溘然长逝，秀保感慨秀吉时代的老臣一一辞世，悲怆之中作和歌一首寄托哀思；
五月中，丰臣秀赖晋升为右大臣，河内满国晋升从三位大纳言，河内光国晋升正四位中纳言，秀保辞去左大臣之职，外界认为这是为秀赖晋升关白做准备；
十月初。后水尾天皇驾临伏见，希望秀保担任太政大臣，秀保担忧引起秀赖不满，再次拒绝；藤堂高虎得知此事。暗中招来岛清兴和后藤基次商议；
十一月三日，藤堂高虎将家督之位传予藤堂高次，自己前往伏见居住，与秀保诸子往来密切；
五年1621
四月初五，大阪一带发生地震，波及京都和伏见，京都御所因此受损，多名女官及大臣罹难，后水尾天皇幼子因惊吓过度，在逃难途中夭折；秀保遣人将皇族接往伏见暂住。天皇深感其忠；
四月初八，天皇率众返回御所，傍晚，众人于御所后花园废墟中发现一块奇石，上以血书“清源归流”。侍女报之天皇，天皇不得解，乃请阴阳寮之阴阳师土御门一族前来查探；
四月初九，阴阳师告知天皇，“清源”寓意“清和源氏”，“归流”乃是回归“主流”之意，综观之。